《老鼠总动员》的故事发生在一座绿意盎然、充满生命力的森林里。每当人类消失的那一瞬间，整座森林就"活"了起来，一群爱聊天的树木哗啦啦地唱着风一样的歌，小动物们也开心地玩乐着、生活着。然而人类的贪婪和欲望改变了这和谐的一切......，达邦多为了自己的研究大肆虐杀森林中的动物，并将他们制作成标本，而达邦多太太为了参加朋友的聚会决定杀死森林里所有的鼹鼠并剥下他们的皮毛制成一件大衣......灾难降临了，森林打破了以往的快乐，动物东逃西窜，恐惧、哀嚎、绝望充斥在空气中，除了福里之外所有的鼹鼠都被达邦多和他的助手抓住并关进了笼子里，死神一步步逼近这些小生命......侥幸逃过一劫的小鼹鼠福里该如何解救他的心上人琳达以及其他的同伴？她能否和森林里的好朋友同心协力一起而奋战，重新找回属于这片森林的快乐与和谐呢？达邦多以及他的太太又将会遭到什么样的惩罚？